آشنایی با انواع نمودار یکی از پایه‌های مهم در انجام آنالیزهای زیستی است. در علوم زیستی، داده‌ها فقط عدد خالی نیستند؛ هر عدد نشان‌دهنده بیان یک ژن، غلظت یک پروتئین، تعداد سلول، میزان بقا، یا پاسخ یک موجود زنده به یک دارو باشد. اگر پژوهشگر نتواند این داده‌ها را درست نمایش دهد، حتی تحلیل خوب هم ممکن است برای مخاطب نامفهوم بماند. به همین دلیل، انتخاب نمودار مناسب بخشی از خود تحلیل علمی است، نه فقط مرحله زیباسازی نتایج. در این مقاله، با تمرکز بر آشنایی با انواع نمودار و نیز انواع نمودار در آنالیزهای زیستی، مهم‌ترین شیوه‌هایی را مرور می‌کنیم که در زیست‌شناسی، بیوانفورماتیک، میکروبیولوژی، ژنتیک، اکولوژی، و علوم پزشکی برای مصورسازی، دیده می‌شوند. چرا شناخت نمودارها در علوم زیستی مهم است؟ در آنالیزهای زیستی، […]

معمولا نوشتن یک مقاله برای بسیاری از دانشجویان یک فرآیند استرس‌زا است و آن را به عنوان یک چالش بزرگ در نظر می‌گیرند. بعضی اوقات اگر موضوع پروژه بیوانفورماتیکی، باشد، نگارش مقاله آن برای بسیاری از دانشجویان از خود تحلیل ها دشوارتر است. اما باید بدانید که نگارش بیوانفورماتیکی نکات و ترفندهای خود را دارد و اگر به خوبی با آن‌ها آشنا شویم، دیگر این موضوع یک چالش نیست و طی چند روز می‌توان مقاله پروژه خود را نوشت. در پروژه های بیوانفورماتیک معمولا با حجم زیادی از داده، چندین مرحله پیش پردازش، ابزارهای متنوع، معیارهای آماری مختلف و خروجی های متعدد روبه رو هستیم. همین مسئله باعث می شود دانشجو پس از پایان کار عملی، هنگام نوشتن مقاله با یک پرسش جدی مواجه شود: از […]

در ژنومیک، به‌دست‌آوردن توالی DNA پایان کار نیست، بلکه آغاز تفسیر زیستی آن است. وقتی ژنوم یک موجود زنده تعیین توالی می‌شود، پژوهشگر در مرحله اول فقط با رشته‌ای بلند از بازهای نوکلئوتیدی روبه‌رو است؛ رشته‌ای متشکل از A، T، C و G که به‌تنهایی هنوز نمی‌گوید کدام بخش ژن است، کدام ناحیه در تنظیم بیان ژن نقش دارد، و کدام توالی ممکن است محصولی با اهمیت زیستی تولید کند. به همین دلیل، پس از تعیین توالی، مرحله‌ای ضروری آغاز می‌شود که در بیوانفورماتیک و ژنومیک از آن با نام Annotation یاد می‌شود. به بیان ساده، Annotation فرایند نسبت دادن معنا، برچسب و توضیح زیستی به توالی خام ژنوم است. در این فرایند تلاش می‌شود مشخص شود هر ناحیه از ژنوم چه جایگاهی در ساختار و […]