معرفی دوره
بیان ژن و بررسی آن همواره یکی از مهم ترین اقدامات به منظور بررسی شرایط بیماری نسبت به حالت نرمال آن بوده است. یا در شرایطی که سلول با یک داروی به خصوص تیمار می شود، برای محقق بررسی بیان ژن مورد هدف نتایج مهمی را ایجاد خواهد کرد. یک تکنیک قدرتمند برای این هدف، Real-time PCR است. اما این تکنیک محدودیت هایی دارد که به ما اجازه بررسی تعداد زیادی ژن (مثلا تمام ژن های سلول هدف) را نمی دهد. در این شرایط لازم است سراغ ابزارهای High-throughput برویم. این ابزارها طی سالیان اخیر سبب تولید داده های بسیار زیادی گشته اند. تکنیک های میکرواری (Microarray) و RNAseq دو روش محبوب برای بررسی بیان هزاران ژن مختلف در سلول می باشند. اما آیا فقط تولید داده کافی است؟ قطعا آنالیز داده های میکرواری و نیز RNAseq مرحله مهم تری به شمار می آید تا بتوان به درک صحیحی از وضعیت سلول رسید.
چرا آنالیز میکرواری و RNAseq؟
حوزه سیستمز بیولوژی طی سالیان اخیر به یک حوزه محبوب در میان محققین علوم زیستی تبدیل گشته است. شروع مطالعات سیستمز بیولوژی، وابسته به استفاده از داده های عظیم تولید شده توسط میکرواری و یا RNAseq است. محقق می تواند خود اقدام به جمع آوری نمونه های مورد نظر نموده و سپس این تکنیک ها را به صورت آزمایشگاهی انجام دهد و از داده های موجود ادامه پروژه را پیش برد، یا می توان از داده های موجود در دیتابیس های مرتبط استفاده نمود. در هر دو روش لازم است که داده های حاصل آنالیز گردند. آنالیز صحیح داده های میکرواری و یا RNAseq یک مرحله بسیار مهم و حیاتی می باشد.
به منظور انجام آنالیز، می توان از ابزارهای توسعه داده شده و در دسترس استفاده کرد و یا با کمک زبان R که یک ابزار بسیار قدرتمند برای این هدف است، کمک گرفت. در هر دو صورت، آگاهی نسبت به پروسه آنالیز داده های RNAseq و میکرواری یک امر مهم به شمار می آید، چرا که خروجی این مرحله مورد استفاده تمامی تفسیرهای پایین دست خواهد بود.
چرا دوره آنالیز داده های میکرواری و RNAseq دایا زیست فناوران؟
تخصص اصلی مدرس دوره سیستمز بیولوژی و آنالیز داده های مرتبط با این حوزه می باشد. بنابراین، این دوره با هدف انتقال دانش و تجربه واقعی خواهد بود. علاوه بر آن، تمامی نکات مهم در مورد دو تکنیک میکرواری و RNAseq در این آموزش بررسی خواهند شد. آنالیز داده های حاصل به دو روش Automated و Manual آموزش داده می شود. در روش Automated، با کمک ابزارهای از پیش توسعه داده شده آنالیزها پیش خواهند رفت و در روش Manual، زبان برنامه نویسی R مورد استفاده قرار خواهد گرفت. لازم به ذکر است با توجه به اهمیت R در مطالعات اینچنینی، تمرکز اصلی دوره بر آنالیز داده های میکرواری و RNAseq با کمک زبان برنامه نویسی R خواهد بود.
موضوع مهم بعدی آموزش مفاهیم آماری مرتبط با این حوزه است. در دوره دایا زیست فناوران، شما تمامی نکات مهم آماری که در آنالیز داده های RNAseq و میکرواری مورد نیاز می باشند را آموزش خواهید دید تا به درک کاملی از مسیر چنین پروژه هایی دست یابید.
پیش نیاز دوره
با توجه به اینکه در این دوره به صورت Manual آنالیز داده های میکرواری و RNAseq آموزش داده می شوند، لذا داشتن اطلاعات کافی پیرامون زبان برنامه نویسی R امری حیاتی است. اگرچه شما می توانید با روش Automated که در طی دوره آموزش داده می شود نیز اقدام به آغاز پروژه های مرتبط نمایید. اما توصیه می کنیم به علت اهمیت R و تاثیر مثبتی که در چنین پروژه هایی دارد، یادگیری آن و استفاده از روش Manual را نیز در برنامه خود قرار دهید.
اگر در حوزه سیستمز بیولوژی و یا حوزه های مرتبط مشغول فعالیت هستید، آنالیز صحیح داده های میکرواری و RNAseq یک امر ضروری به منظور ارتقا کیفیت و سطح کاری به حساب می آید. همچنین شما می توانید از داده های حاصل از این تکنیک ها در هر پروژه ای بسته به خلاقیت خود استفاده کنید. نکته مهم توجه به بحث آنالیز و تسلط کافی بر این قسمت از پروژه است، آن هم به علت نقش تعیین کننده ای که خروجی این مرحله در آنالیزهای پایین دست دارد.
استفاده از زبان R، سبب می شود کنترل بهتر و بیشتری طی آنالیزها داشته باشید. همچنین قدرت شخصی سازی آنالیزها و نمودارها زمانی که از R برای آنالیز داده های میکرواری و RNAseq استفاده می کنید بیشتر است.
شما می توانید از طریق تیکت اقدام به ارسال سوالات خود پیرامون هریک از مباحث دوره نمایید.
بله، بازپخش تمامی وبینارها از طریق این پنل قابل دسترسی خواهند بود.
