وبلاگ
چرا بسیاری از پروژههای طراحی دارو شکست میخورند؟
در فرایند توسعه دارو بارها مشاهده میشود که یک ترکیب شیمیایی در محیط آزمایشگاه عملکردی بسیار امیدوارکننده دارد، اما زمانی که وارد بدن انسان میشود، اثربخشی آن کاهش پیدا میکند یا حتی به طور کامل از بین میرود. این مسئله نه یک استث …
تفاوت Sensitivity و Specificity در تستهای تشخیصی
اگر با تستهای آزمایشگاهی و تشخیصی سروکار داشته باشید، احتمالا با دو مفهوم مهم به نام حساسیت و اختصاصیت روبهرو شدهاید. هیچ تست تشخیصی کاملا بدون خطا نیست و هر آزمایش ممکن است در برخی موارد نتیجه نادرست بدهد. به همین دلیل، برای ا …
P-value چیست و در مطالعات بیولوژیکی چه چیزی را نشان میدهد؟
یکی از اصطلاحاتی که دانشجویان بیولوژی به کررات با آن مواجه میشوند، P-value است. مفهومی که با طیف وسیع مطالعات و پژوهشهای بیولوژیکی و پزشکی گره خورده است. به صورت کلی، P-value یک ابزار آماری است که به ما کمک میکند بفهمیم آیا نتی …
Data normalization در دادههای بیولوژیکی چیست و چه انواعی دارد؟
اگر تاکنون یک بار با دادههای زیستی کار کرده باشید، احتمالا نام فرآیندی مرسوم به نام Data normalization را شنیدهاید. مرحلهای مهم که بسیاری از افراد آن را انجام میدهند، اما از ماهیت و تاثیری که بر دادهها میگذارد، آگاهی کامل ند …
راهنمای جامع ورود به کارهای پژوهشی در سرطان
پژوهش در سرطان، یکی از حوزههای پژوهشی است که طیف وسیعی از دانشجویان به فعالیت در آن علاقهمند هستند. در کنار علایق زیادی که این افراد به فعالیت علمی در سرطان دارند، معمولا اکثر آنها با شکستهای پی در پی مواجه میشوند. شکستهایی …
Batch effect چیست و چرا میتواند نتیجه آزمایش را غیرقابل اعتماد کند؟
در بسیاری از پژوهشهای آزمایشگاهی، پژوهشگران تلاش میکنند شرایط آزمایش را تا جای ممکن ثابت نگه دارند. با این حال، حتی در شرایط کنترلشده نیز ممکن است عواملی وارد آزمایش شوند که نتیجهها را تحت تاثیر قرار دهند. یکی از این عوامل مهم …
Gene ontology چیست و چرا اکثر مقالات بیوانفورماتیک از آن استفاده میکنند؟
Gene ontology یا بهاختصار GO یکی از ابزارهای بسیار مهم برای توصیف ویژگیهای ژنها و پروتئینهاست. این ابزار کمک میکند زبان مشترکی برای توضیح عملکرد ژنها در موجودات مختلف داشته باشیم. در سالهای اخیر، حجم دادههای ژنومی بهطور چ …
راهنمای جامع آشنایی با روشهای مختلف توالی یابی DNA
وقتی پروژه ژنوم انسان (Human Genome Project یا HGP) در سال ۲۰۰۱ اولین پیشنویس توالی ژنوم انسان را منتشر کرد، بیل کلینتون رئیسجمهور وقت آمریکا آن را «شگفتانگیزترین نقشهای که بشر تاکنون تولید کرده است» توصیف کرد. این دستاورد حاص …
تکنیک RNA sequencing چیست و چه کاربردی دارد؟
سلولهای زنده و تعاملات درونی آنها، همچنان یکی از بزرگترین معماهای بشریاند که به شکل کامل ساز و کار آنها درک نشده است. هزاران ژن درون هر سلول به طور هماهنگ فعال و غیرفعال میشوند تا فرآیندهای حیاتی مانند رشد، تقسیم سلولی، پاسخ …
پکیجهای R را از کجا دریافت کنیم؟ تفاوت بین CRAN و Bioconductor
زبان برنامه نویسی R، معروفترین زبان برای انجام پروژههای علمی است و بهصورت پیشفرض امکانات پایهای قدرتمندی برای تحلیل داده، آمار و رسم نمودار دارد، اما قدرت واقعی این زبان از پکیجهای مختلفی که برای آن ارائه میشوند، میآید. پک …
آشنایی با ایجنتهای هوش مصنوعی
اگر در سالهای اخیر با ابزارهایی مثل ChatGPT یا مدلهای هوش مصنوعی کار کرده باشید، احتمالا متوجه شدهاید که این سیستمها میتوانند به سوالات پاسخ دهند، متن تولید کنند یا حتی کد بنویسند. اما نسل جدیدی از سیستمهای هوش مصنوعی در حال …